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Bioinformática

Código 13422
Ano 3
Semestre S2
Créditos ECTS 6
Carga Horária PL(30H)/T(30H)
Área Científica Ciências Biomédicas
Tipo de ensino Presencial
Objetivos Gerais e Resultados de Aprendizagem A disciplina visa apresentar aos alunos diferentes algoritmos e técnicas computacionais utilizadas na Bioinformática moderna e respetiva aplicação à resolução de problemas em biologia e medicina, com ênfase nas aplicações da biologia molecular.
No fim desta disciplina os alunos deverão ser capazes de:
- Conhecer as bases de dados biológicos mais importantes e saber recolher informação destas bases de dados.
- Saber parametrizar de forma adequada os algoritmos de pesquisa e de alinhamento de sequências mais comuns.
- Compreender as motivações, os pressupostos e limitações das diversas técnicas computacionais que são aplicadas para resolver problemas em biologia.
- Identificar direções para investigação em Bioinformática.
Conteúdos / Programa 1. Introdução.
2. Fundamentos de Biologia Molecular.
3. Bases de dados de informação biológica.
4. Alinhamento de sequências biológicas.
5. Métodos heurísticos para pesquisa a bases de dados.
6. Microarrays e análise de dados de expressão genética.
7. Alinhamento estrutural de proteínas.
8. Previsão da estrutura e função de proteínas.
9. Aplicações e investigação na Bioinformática.
Bibliografia / Fontes de Informação 1. Bibliografia principal
- Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015.
- Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010.

2. Bibliografia complementar
- Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006.
- Introduction to Bioinformatics, 2nd edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2002.
- Digital Code of Life, Glyn Moody, Wiley, 2004.
- Bioinformatics for Dummies, 2nd edition, Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame, Wiley, 2006.
Actividades de Ensino-Aprendizagem e Metodologias Pedagógicas Aulas teóricas com exposição da matéria pelo professor seguida de discussão dos algoritmos apresentados, complementada com pequenos exercícios teórico-práticos. Aulas práticas com utilização de computadores e realização de trabalhos de grupo. Para os estudantes aprenderem a resolver problemas da área da Biologia e Medicina com recurso a técnicas Bioinformáticas é importante saberem utilizar as ferramentas adequadas. Os estudantes têm oportunidade de, com orientação do Professor, utilizar essas ferramentas e testar diferentes parametrizações. Está prevista também a realização de uma apresentação individual sobre uma área de investigação recente em Bioinformática.
Língua Português
Data da última atualização: 2018-07-04
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