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Modelação Molecular

Código 11137
Ano 1
Semestre S2
Créditos ECTS 6
Carga Horária T(30H)/TP(30H)
Área Científica Química Medicinal
Tipo de ensino Presencial
Estágios Não aplicável
Objectivos de Aprendizagem Esta UC pretende fornecer competências no manuseamento computacional de estruturas químicas e na análise de conjuntos de dados estabelecendo relações entre estrutura e propriedades farmacológicas, que serão aplicados na indústria e na investigação ligadas à Química Medicinal.
No final da UC o estudante deve ter adquirido competências de forma a conseguir determinar se uma molécula pode ser
considerada um fármaco, através da análise das interações que a modelação molecular permite desenvolver, visando essencialmente a farmacocinética e/ou a atividade biológica destes compostos.
Conteúdos programáticos 1. Avaliação virtual de líder de série
2. Medidas de similaridade molecular
3. Avaliação de similaridade molecular e métodos de diversidade molecular, utilizando dados de atividade biológica
4. Sistema quimioinformático baseado na web para a descoberta de novos fármacos
5. Aplicações da quimioinformática na triagem rápida: Considerações práticas
6. Estratégias para a identificação e geração de conjuntos compostos com a informação desejada
7. Métodos de aplicação do paradigma relação estrutura-atividade quantitativa (QSAR)
8. Recentes aplicações de QSAR no desenho de fármacos.
9. Simulação computacional em multi-escala: métodos computacionais avançados capazes de tratar diferentes escalas: molecular, nano, entre outras
10. Simulação computacional de nanomateriais poliméricos como portadores de moléculas com propriedades terapêuticas
Bibliografia principal Bibliografia principal
- Satyanarayanajois, S.D. “Drug Design and Discovery-Methods and Protocols” 2011 Humana Press, New Jersey, USA
- Bajorath, J. “Chemoinformatics Concepts, Methods, and Tools for Drug Discovery” 2004 Humana Press, New Jersey, USA
- Ekinci, D. “Medicinal Chemistry and Drug Design” 2012 InTech, Croatia
- Hinchliffe, A. “Molecular Modeling for Beginners” 2nd Ed. 2008 John Wiley & Sons Ltd, UK
- Jensen, F. “Introduction to Computational Chemistry”, 2nd Ed. 2007 John Wiley & Sons Ltd, UK
- Krogsgaard, L. P., Liljefors, T., Madsen, U. “Textbook of Drug Design and Discovery”, 3rd Ed. 2002 Taylor & Francis, USA
- Cramer, C. J., “Essentials of Computational Chemistry”, 2nd Ed. 2004 John Wiley & Sons Ltd, UK
Língua Português
Data da última atualização: 2014-06-05
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