| Código |
11492
|
| Ano |
1
|
| Semestre |
S2
|
| Créditos ECTS |
6
|
| Carga Horária |
PL(30H)/T(30H)
|
| Área Científica |
Informática
|
|
Tipo de ensino |
Presencial
|
|
Objectivos de Aprendizagem |
A disciplina visa apresentar aos alunos diferentes algoritmos e técnicas computacionais utilizadas na Bioinformática moderna e respectiva aplicação à resolução de problemas em biologia e medicina, com ênfase nas aplicações da biologia molecular.
No fim desta disciplina os alunos deverão ser capazes de:
- Conhecer as bases de dados biológicos mais importantes e saber extrair informação destas bases de dados.
- Compreender as motivações, os pressupostos e limitações das diversas técnicas computacionais que são aplicadas para resolver um problema particular em biologia.
- Explorar as implementações existentes dos algoritmos de pesquisa e de alinhamento de sequências mais comuns e saber parametrizar os mesmos de forma adequada.
- Identificar direções para investigação em Bioinformática.
|
|
Conteúdos programáticos |
1. Introdução.
2. Fundamentos de Biologia Molecular.
3. Bases de dados de informação biológica.
4. Alinhamento de sequências biológicas.
5. Métodos heurísticos para pesquisa a bases de dados.
6. Microarrays e análise de dados de expressão genética.
7. Alinhamento estrutural de proteínas.
8. Previsão da estrutura e função de proteínas.
9. Aplicações e investigação na Bioinformática.
|
|
Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
Aulas teóricas com exposição da matéria pelo professor seguida de discussão dos algoritmos apresentados, complementada com pequenos exercícios teórico-práticos. Aulas práticas com utilização de computadores e realização de trabalhos de grupo. Para os estudantes aprenderem a resolver problemas da área da Biologia e Medicina com recurso a técnicas Bioinformáticas é importante saberem utilizar as ferramentas adequadas. Os estudantes têm oportunidade de, com orientação do professor, utilizar essas ferramentas e testar diferentes parametrizações. Está prevista também a realização de um trabalho com apresentação pública sobre uma área de investigação recente em Bioinformática.
|
|
Bibliografia principal |
- Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015.
- Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010.
- Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006.
|
| Língua |
Português
|