Código |
12888
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Ano |
1
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Semestre |
S2
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Créditos ECTS |
6
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Carga Horária |
PL(30H)/T(30H)
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Área Científica |
Informática
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Tipo de ensino |
Presencial
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Estágios |
Não aplicável
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Objectivos de Aprendizagem |
Este curso apresenta conceitos fundamentais e métodos de bioinformática e suas aplicações à bioengenharia. A ênfase é colocada na compreensão dos conceitos transmitidos e na sua imediata aplicação prática, com o objetivo de ajudar os estudantes a utilizar as ferramentas de bioinformática para resolver problemas no seu trabalho de investigação. No fim desta disciplina os alunos deverão ser capazes de: - Extrair programaticamente informação das bases de dados biológicos mais importantes. - Compreender as motivações, os pressupostos e limitações das diversas técnicas computacionais estudadas. - Utilizar uma linguagem de programação para implementar e adaptar um conjunto selecionado de algoritmos estudados. - Discutir uma linha de investigação recente em bioinformática.
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Conteúdos programáticos |
1. Introdução à Bioinformática. 2. Genoma, Transcriptoma, Proteoma e Metaboloma. 3. Bases de dados de informação biológica. 4. Armazenamento, organização e formato dos dados biológicos. 5. Competências práticas de programação. 6. Alinhamento de sequências par-a-par. 7. Alinhamento múltiplo de sequências. 8. Métodos heurísticos para pesquisa a bases de dados. 9. Microarrays e análise de dados de expressão génica. 10. Análise filogenética. 11. Alinhamento estrutural de proteínas. 12. Aprendizagem automática para a Bioinformática. 13. Previsão da estrutura e função de proteínas. 14. Autómatos celulares e simulação em biologia sistémica.
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Bibliografia principal |
Não é necessário livro de texto para este curso. Todos os materiais discutidos serão entregues aos alunos ou disponibilizados na plataforma de e-learning. Recomenda-se a leitura dos seguintes livros: Pevsner, J. (2009). Bioinformatics and functional genomics. John Wiley & Sons. Fogel, G. B., & Corne, D. W. (Eds.). (2002). Evolutionary computation in bioinformatics. Morgan Kaufmann.
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Língua |
Português
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