| Código |
12888
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| Ano |
1
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| Semestre |
S2
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| Créditos ECTS |
6
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| Carga Horária |
PL(30H)/T(30H)
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| Área Científica |
Informática
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Tipo de ensino |
Presencial
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Estágios |
Não aplicável
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Objectivos de Aprendizagem |
Este curso apresenta conceitos fundamentais e métodos de bioinformática e suas aplicações à bioengenharia.
A ênfase é colocada na compreensão dos conceitos transmitidos e na sua imediata aplicação prática, com o objetivo de ajudar os estudantes a utilizar as ferramentas de bioinformática para resolver problemas no seu trabalho de investigação.
No fim desta disciplina os alunos deverão ser capazes de:
- Extrair programaticamente informação das bases de dados biológicos mais importantes.
- Compreender as motivações, os pressupostos e limitações das diversas técnicas computacionais estudadas.
- Utilizar uma linguagem de programação para implementar e adaptar um conjunto selecionado de algoritmos estudados.
- Discutir uma linha de investigação recente em bioinformática.
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Conteúdos programáticos |
1. Introdução à Bioinformática.
2. Genoma, Transcriptoma, Proteoma e Metaboloma.
3. Bases de dados de informação biológica.
4. Armazenamento, organização e formato dos dados biológicos.
5. Competências práticas de programação.
6. Alinhamento de sequências par-a-par.
7. Alinhamento múltiplo de sequências.
8. Métodos heurísticos para pesquisa a bases de dados.
9. Microarrays e análise de dados de expressão génica.
10. Análise filogenética.
11. Alinhamento estrutural de proteínas.
12. Aprendizagem automática para a Bioinformática.
13. Previsão da estrutura e função de proteínas.
14. Autómatos celulares e simulação em biologia sistémica.
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Bibliografia principal |
Não é necessário livro de texto para este curso. Todos os materiais discutidos serão entregues aos alunos ou disponibilizados na plataforma de e-learning.
Recomenda-se a leitura dos seguintes livros:
Pevsner, J. (2009). Bioinformatics and functional genomics. John Wiley & Sons.
Fogel, G. B., & Corne, D. W. (Eds.). (2002). Evolutionary computation in bioinformatics. Morgan Kaufmann.
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| Língua |
Português
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