| Código |
15044
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| Ano |
1
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| Semestre |
S2
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| Créditos ECTS |
5
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| Carga Horária |
TP(40H)
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| Área Científica |
Biomedicina/Medicina/Bioquímica
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Objectivos de Aprendizagem |
Após a conclusão do curso, o aluno deverá:
- Conhecer as várias técnicas básicas e avançadas de microscopia de fluorescência usadas na investigação biomédica.
- Saber selecionar o modo de aquisição de imagem adequada ao objetivo pretendido.
- Ter adquirido as noções fundamentais sobre métodos de análise de imagens como digitalização, aperfeiçoamento de imagem, segmentação e classificação de características.
- Realizar medições manuais e automáticas usando ferramentas de análise de imagem.
- Realizar rastreamento de objetos.
- Entender as aplicações e limitações de cada técnica.
- Conhecer e aplicar as noções fundamentais de ética na análise de Imagem.
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Conteúdos programáticos |
Introdução à Microscopia de Fluorescência
Seccionamento Ótico
Imagiologia de Células Vivas
Microscopia de Super-Resolução
Hands-On Microscópios (Axio Observer Z1, Axio Imager Z2, Confocal LSM 710)
Introdução à Análise de Imagem
Introdução ao FIJI (Is Just ImageJ)
Hands-On FIJI (Análise Intensidade de Fluorescência, Área de Lesão & Colocalização)
Introdução ao Software de Microscopia ZEN
Introdução ao Imaris
Hands-On Imaris (Análise de Tracking)
Como Analisar Grandes Imagens: Software QuPath
Introdução ao Huygens
Hands-On Huygens (Deconvolução de Imagens 3D Widefield)
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Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
O curso consiste em sessões teórico-práticas, sessões práticas Hands-On nos laboratórios de microscopia e sessões práticas de análise de imagem.
As sessões teórico-práticas permitem fornecer as bases teóricas sobre as técnicas de microscopia de fluorescência e os conceitos base sobre aquisição e análise de imagens em investigação biomédica. As sessões Hands On possibilitam a aplicação dos conceitos apresentados nas sessões teórico-práticas e o uso das ferramentas disponíveis para construir fluxos de trabalho adequado para um determinado objetivo de investigação. A avaliação envolve a aplicação individual dos conhecimentos em contextos que os alunos poderão transpor para os seus projetos de investigação.
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Bibliografia principal |
- Fluorescence Microscopy: From Principles to Biological Applications, 2nd Edition. Ulrich Kubitscheck (Editor) ISBN: 978-3-527-33837-5 June 2017 Wiley-Blackwell
- Bioimage Data Analysis, Edited by Kota Miura, Wiley-VCH. ePDF ISBN: 978-3-527-80092-6
- Quantitative Imaging in Cell Biology, Methods in Cell Biology, Volume 123 (2014). Editors Jennifer C. Waters & Torsten Wittmann
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| Língua |
Português
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