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Estrutura e Função das Proteínas

Código 8438
Ano 1
Semestre S2
Créditos ECTS 6
Carga Horária TP(60H)
Área Científica Bioquímica
Tipo de ensino Presencial
Estágios Não aplicável.
Objectivos de Aprendizagem O objetivo desta unidade curricular é estudar as características estruturais e conformacionais das proteínas e a sua função biológica. Pretende-se também relacionar alterações da conformação com o surgimento de patologias, através de exemplos de proteínas que desempenhem funções biológicas diversas.
No final desta UC o estudante deve ser capaz de:
-Identificar e descrever os princípios fundamentais que definem a estrutura e conformação; das proteínas e os mecanismos que controlam o folding proteico in vitro e in vivo;
-Relacionar o aparecimento de patologias neurodegenerativas com alterações conformacionais nas proteínas;
-Explicar o papel do sistema da ubiquitina e proteossoma no turnover proteico;
-Aplicar metodologias modernas (dicroísmo circular, espectrometria de massa, ressonância magnética molecular, ressonância de plasma de superfície) na deteção, identificação e análise biomolecular;
-Demonstrar capacidade crítica na análise e apresentação de artigos científicos;
Conteúdos programáticos 1-Visualização e desenho computacional de moléculas orgânicas. Análise de interações moleculares entre recetores proteicos e ligandos através de métodos computacionais (Docking).
2- Métodos físicos de determinação da estrutura das proteínas: Cristalografia por difração de raios x e Ressonância Magnética Nuclear. Dicroísmo Circular (DC). Determinação de interações proteína-ligando por ressonância de plasma de superfície.
3-A estrutura e função de proteínas membranares. Expressão, purificação e métodos de cristalização.
4-Turnover proteico: sistema da ubiquitina e proteossoma
5-Folding proteico. Estabilidade conformacional. Mecanismos de folding in vitro e in vivo. Misfolding e doença: mecanismos moleculares de formação de agregados proteicos nas doenças neurodegenerativas.
6-Trabalhos Experimentais
Cristalização da Lisozima
DC de proteínas
Determinação da estrutura de uma proteína por RMN
Análise Estrutural de Interações Proteina-Ligando (SPR)
Eletroforese Bidimensional e MALDI-TOF MS
Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação O ensino desta UC será centrado no estudante, em que a sua participação ativa no processo de aprendizagem irá
permitir um maior desenvolvimento das suas capacidades de raciocínio e autoavaliação. A metodologia pedagógica
aplicada fundamenta-se no ensino por objetivos educativos e na aprendizagem baseada em problemas. O professor
orienta os estudantes na pesquisa de informação relevante para a obtenção dos resultados esperados. Os trabalhos
experimentais serão para aplicação dos conhecimentos adquiridos, tanto na execução de técnicas, como na
análise de dados, interpretação de resultados e resolução de problemas.
Avaliação: Nota Final (NF): Módulo 1 (15 %) + Módulos 2 e 3 (30%+40%)+ Seminário (15%). Módulo 1: Trabalho de Bioinformatica. Módulos 2+3: 2 Testes on line. Seminário: Elaboração de um protocolo experimental. O exame final corresponde a 70% da NF (Mod 2 e 3). Nota Minima Frequência: 9,5 no Mod 1 e no Seminário. Aprovação à UC: min 9,5 em cada componente da NF
Bibliografia principal 1-Principal:
-Kessel, A., Ben-Tal, N (2018) “Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion” 2nd Edition, CRC Press, Taylor and Francis Group, (ISBN 978-1-4987-4717-2)
-Xiong, J (2012) Essential Bioinformatics, Cambridge University Press (ISBN: 9780511806087)
-Petsko, G. & Ringe, D. (2008) "Protein Structure and Function", Primers in Biology, Oxford University Press (ISBN: 9780199556847)
-Whitford, D. (2005) "Proteins: Structure and Function", Wiley (ISBN: 978-0-471-49894-0)
- Young, D. (2009) Computational drug design: a guide for computational and medicinal chemists, John Wiley & Sons, Ltd. (ISBN: 978-0-470-12685-1)
-Artigos científicos selecionados.

2-Complementar:
-Muñoz, V (2008) Protein Folding, Misfolding and Aggregation, RSC Biomolecular Siciences (ISBN 978-1-84755-828-2)
- Patrick, G.L. (2010) An Introduction to Medicinal Chemistry, 4th Ed., Oxford University Press. ISBN: 9780198749691
Língua Português
Data da última atualização: 2020-06-17
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