Código |
9112
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Ano |
3
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Semestre |
S2
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Créditos ECTS |
6
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Carga Horária |
PL(30H)/T(30H)
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Área Científica |
Bioengenharia
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Tipo de ensino |
Presencial
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Objectivos de Aprendizagem |
A disciplina visa apresentar aos alunos diferentes algoritmos e técnicas computacionais utilizadas na Bioinformática moderna e respectiva aplicação à resolução de problemas em biologia e medicina, com ênfase nas aplicações da biologia molecular. No fim desta disciplina os alunos deverão ser capazes de: - Conhecer as bases de dados biológicos mais importantes e saber extrair informação destas bases de dados. - Compreender as motivações, os pressupostos e limitações das diversas técnicas computacionais que são aplicadas para resolver um problema particular em biologia. - Explorar as implementações existentes dos algoritmos de pesquisa e de alinhamento de sequências mais comuns e saber parametrizar os mesmos de forma adequada. - Identificar direções para investigação em Bioinformática.
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Conteúdos programáticos |
1.Introdução à Bioinformática 2.Bases de dados de interesse biológico 3.Noções básicas de Biologia Molecular 4.Noções básicas de Algoritmos 5.Alinhamento de sequências simples 6.Alinhamento de sequências múltiplas 7.Clustering e Biclustering 8.Árvores filogenéticas
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Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
Aulas teóricas com exposição da matéria pelo professor seguida de discussão dos algoritmos apresentados, complementada com pequenos exercícios teórico-práticos. Aulas práticas com utilização de computadores e realização de trabalhos de grupo. Para os estudantes aprenderem a resolver problemas da área da Biologia e Medicina com recurso a técnicas Bioinformáticas é importante saberem utilizar as ferramentas adequadas. Os estudantes têm oportunidade de, com orientação do professor, utilizar essas ferramentas e testar diferentes parametrizações. Está prevista também a realização de dois trabalhos com apresentação pública sobre áreas de investigação recente em Bioinformática.
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Bibliografia principal |
1.Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015. 2.Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010. 3.Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006. 4.An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N.C, Jones & P. Pevzner, MIT Press, 2004 5.Introduction to Bioinformatics, 4th Edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2014. 6. Artigos e material disponibilizado pelo docente.
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Língua |
Português
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