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Design Computacional de Fármacos

Código 10263
Ano 3
Semestre S2
Créditos ECTS 6
Carga Horária T(30H)/TP(30H)
Área Científica Química Medicinal
Tipo de ensino Presencial com recurso a e-learning
Objectivos de Aprendizagem Esta Unidade Curricular tem como objectivo fornecer competências específicas no manuseamento computacional de estruturas químicas e na análise de conjuntos de dados estabelecendo relações entre estrutura e propriedades farmacológicas, bem como fortalecer alguns conceitos já anteriormente adquiridos. No final da unidade curricular o estudante deve ter adquirido competências de forma a aplicar os conhecimentos anteriormente adquiridos e planear as melhores estratégias para o design de um fármaco simples, prever as interações com uma determinada molécula-alvo, prever a fármacocinética ou a actividade biológica de compostos conhecidos.
Conteúdos programáticos 1. Mecânica quântica e molecular
2. Desenho de estruturas químicas
3. Estruturas 3D
4. Minimização de energias
5. Visualização de moléculas 3D
6. Dimensões moleculares
7. Propriedades moleculares
7.1 Cargas parciais
7.2 Potenciais electrostáticos moleculares
7.3 Orbitais moleculares
7.4 Transições espectroscópicas
8. Análise conformacional
9. Comparação de estruturas e sobreposições
10. Identificação da conformação activa
11. Identificação 3D de farmacóforo
11.1 Cristalografia de raio X
11.2 Comparação estrutural de produtos activos
11.3 Identificação automática de farmacóforos
12. Procedimentos para efectuar o Docking
12.1 Docking manual
12.2 Docking automático
13. Screening automatizado de base dados para compostos líder
14. Mapeamento de proteínas
14.1 Construção de uma proteína modelo
14.2 Construção de um local de ligação
15. Desenho de novo
16. Planeamento de uma síntese combinatória
17. Uso de bases de dados
18. Estudo de casos práticos
Bibliografia principal 1. C. G. Wermuth, The Practice of Medicinal Chemistry, 3rd Ed., Academic Press, 2008.
2. D. Young, Computational drug design: a guide for computational and medicinal chemists, John Wiley & Sons, Ltd., 2009.
3. T. L. Lemke, D. A. Williams, FOYE´s Principles of Medicinal Chemistry, 6th Ed., Lippincott Williams & Wilkins, 2008.
4. G. L. Patrick, An Introduction to Medicinal Chemistry, 4th Ed., Oxford University Press, 2010.
5. B. A. Bunin, J. Bajorath, B. Siesel, G. Morales, Chemoinformatics: Theory, Practice, and Products, Springer: Dordrecht, 2007.
6. Handbook of Chemoinformatics: from Data to Knowledge, J. Gasteiger, T. Engel, Eds.; Wiley-VCH: Weinheim, 2003.
Língua Português
Data da última atualização: 2012-05-21
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