Informática Aplicada às Ciências Biológicas

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Nuno Gonçalo Coelho Costa Pombo
Código:
12476
Ano:
1
Semestre:
S1
Créditos ECTS:
6
Carga Horária:
PL(30H)/T(30H)
Área Científica:
Biotecnologia
Tipo de ensino:
Presencial
Estágios:
Not applicable
Objectivos de Aprendizagem:
A disciplina visa apresentar aos alunos diferentes algoritmos e técnicas computacionais utilizadas na Bioinformática moderna e respectiva aplicação à resolução de problemas em biologia e medicina, com ênfase nas aplicações da biologia molecular.

No fim desta disciplina os alunos deverão ser capazes de:
- Conhecer as bases de dados biológicos mais importantes e saber extrair informação destas bases de dados.
- Compreender as motivações, os pressupostos e limitações das diversas técnicas computacionais que são aplicadas para resolver um problema particular em biologia.
- Explorar as implementações existentes dos algoritmos mais comuns para os diversos problemas computacionais e saber parametrizar os mesmos de forma adequada.
- Identificar direcções para investigação em Bioinformática.
Conteúdos programáticos:
1 - Introdução à Bioinformática;
2- Base de dados de interesse biológico;
3- Algoritmos de alinhamento de sequências;
4- Algoritmos preditivos
5- Análise de dados
6- Aplicações e investigação em Bioinformática.
Bibliografia principal:
1. Bibliografia principal
• An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N. C. Jones and P. Pevzner, MIT Press, 2004.
• Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006.
• A First Course in Systems Biology, Garland Science, 2012


2. Bibliografia complementar
•Introduction to Bioinformatics, 2nd edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2002.
• Biological Sequence Analysis - Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh and Graeme Mitchison, Cambridge University Press, 2004.
• Analyzing Microarray Gene Expression Data, Geoffrey J. Maclachlan, Kim Anh-Do and Christophe Ambroise, Wiley, 2004.
• Digital Code of Life, Glyn Moody, Wiley, 2004.
• Bioinformatics for Dummies, 2nd edition, Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame, Wiley, 2006
Língua:
Português
Esta informação promove os seguintes Objetivos de Desenvolvimento Sustentável da ONU:
Garantir o acesso à educação inclusiva, de qualidade e equitativa, e promover oportunidades de aprendizagem ao longo da vida para todos