| Código |
12486
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| Ano |
1
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| Semestre |
S2
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| Créditos ECTS |
6
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| Carga Horária |
TP(60H)
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| Área Científica |
Biotecnologia
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Tipo de ensino |
Presencial
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Estágios |
Não aplicável.
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Objectivos de Aprendizagem |
O objetivo desta unidade curricular é estudar as características estruturais e conformacionais das proteínas e a sua função biológica. Pretende-se também relacionar alterações da conformação com o surgimento de patologias, através de exemplos de proteínas que desempenhem funções biológicas diversas.
No final desta UC o estudante deve ser capaz de:
-Identificar e descrever os princípios fundamentais que definem a estrutura e conformação; das proteínas e os mecanismos que controlam o folding proteico in vitro e in vivo;
-Relacionar o aparecimento de patologias neurodegenerativas com alterações conformacionais nas proteínas;
-Explicar as estratégias celulares para controle de qualidade de proteínas;
-Aplicar diferentes métodos de cristalização e análise de proteínas (difração de raios X, dicroísmo circular, espectroscopia de IV, fluorescência, RMN, ressonância de plasma de superfície);
-Demonstrar capacidade crítica na análise e apresentação de artigos científicos;
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Conteúdos programáticos |
1-Visualização e desenho computacional de moléculas orgânicas. Análise de interações moleculares entre proteínas e ligandos por métodos computacionais (Docking).
2- Métodos físicos de determinação da estrutura das proteínas: Cristalografia por difração de raios x e RMN. Dicroísmo Circular (DC). Determinação de interações proteína-ligando por ressonância de plasma de superfície. Espectroscopia de infravermelho e fluorescência.
3-A estrutura e função de proteínas membranares. Expressão, purificação e métodos de cristalização.
4-Estratégias celulares para controle de qualidade de proteínas.
5-Folding proteico. Estabilidade conformacional. Mecanismos de folding in vitro e in vivo. Misfolding e doença: mecanismos moleculares de formação de agregados proteicos nas doenças neurodegenerativas.
6-Trabalhos Experimentais
DC de proteínas
Determinação da estrutura de um aminoácido por RMN
Análise Estrutural de Interações Proteina-Ligando (SPR)
Cristalização da Lisozima
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Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
O ensino desta UC será centrado no estudante, em que a sua participação ativa no processo de aprendizagem irá permitir um maior desenvolvimento das suas capacidades de raciocínio e autoavaliação. A metodologia pedagógica aplicada fundamenta-se no ensino por objetivos educativos e na aprendizagem baseada em problemas. O professor orienta os estudantes na pesquisa de informação relevante para a obtenção dos resultados esperados. Os trabalhos experimentais serão realizados para aplicação dos conhecimentos adquiridos, tanto na execução de técnicas, como na análise de dados, interpretação de resultados e resolução de problemas.
Avaliação- Nota Final (NF): Mod1 (15 %) + Mod2 e 3 (30%+40%)+ Seminário (15%).
Mod1: Trabalho de Bioinformática. Mod2 e 3: 2 Testes on line. Seminário: Elaboração de um protocolo experimental. O exame final corresponde a 70% da NF (Mod 2 e 3). Nota Mínima de Frequência: 9,5 val no Mod 1 e 9,5 no Seminário. Aprovação à UC: 9,5 val em cada componente da NF.
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Bibliografia principal |
1-Principal:
-Kessel, A., Ben-Tal, N (2018) “Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion” 2nd Edition, CRC Press, Taylor and Francis Group, (ISBN 978-1-4987-4717-2)
-Petsko, G. & Ringe, D. (2017) "Protein Structure and Function", Primers in Biology, Oxford University Press (ISBN13 9780878936632)
-Xiong, J (2012) Essential Bioinformatics, Cambridge University Press (ISBN: 9780511806087)
-Whitford, D. (2005) "Proteins: Structure and Function", Wiley (ISBN: 978-0-471-49894-0)
- Young, D. (2009) Computational drug design: a guide for computational and medicinal chemists, John Wiley & Sons, Ltd. (ISBN: 978-0-470-12685-1)
-Artigos científicos selecionados.
2-Complementar:
-Muñoz, V (2008) Protein Folding, Misfolding and Aggregation, RSC Biomolecular Sciences (ISBN 978-1-84755-828-2)
- Patrick, G.L. (2010) An Introduction to Medicinal Chemistry, 4th Ed., Oxford University Press. ISBN: 9780198749691
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| Língua |
Português
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