Bioinformática

Não tem Fotografia:
Virginie dos Santos Felizardo
Código:
15861
Ano:
2
Semestre:
S2
Créditos ECTS:
6
Carga Horária:
T(30H)/TP(30H)
Área Científica:
Biotecnologia
Tipo de ensino:
Presencial
Objectivos de Aprendizagem:
A disciplina visa apresentar aos alunos diferentes algoritmos e técnicas computacionais utilizadas na Bioinformática com foco na sua aplicação prática.

Objetivos específicos:
O1) Familiarização com algoritmos e técnicas computacionais utilizadas actualmente em Bioinformática e respectiva aplicação à resolução de problemas em biologia e medicina.
O2) Exploração de ferramentas computacionais e bases de dados de interesse para a resolução de problemas em Bioinformática.
O3) Identificação de direcções para investigação em Bioinformática.
O4) Aquisição e/ou reforço de soft skills tais como trabalho em equipa, capacidade analítica e de argumentação, discussão de ideias inter-pares e com os docentes, …
Conteúdos programáticos:
1.Introdução à Bioinformática
2. Algoritmos e ferramentas em Bioinformática
3. Bases de dados de interesse biológico
4. Métodos de Alinhamento de sequências e construção de árvores filogenéticas
5. Métodos de deteção de padrões ou motivos
7. Métodos de análise de dados de expressão génica
8. Métodos para estudar a interação de proteínas e redes biológicas
9. Métodos de previsão de estrutura e função de proteínas
Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação:
A avaliação do período de ensino-aprendizagem consiste em 2 provas (resolvidas individualmente), 3 avaliações teórico-práticas resolvidas individualmente) e 1 desafio (em duplas).

Prova de conhecimentos teóricos e práticos (T1 e T2) – 12 (6+6) valores

Avaliação prática, realizada nas aulas teórico-práticas (individual) através de:
3 avaliações teórico-práticas (P1,P2,P3)* –6 (2+2+2) valores
1 desafio (D) –2 valores


Nota final= 0.1xP1+0.1xP2+0.1xP3+0.1*D+0.3*T1+0.3*T2

O aluno obtém a classificação de Aprovado/dispensado de exame ao obter:
- Assiduidade mínima de 60% nas aulas teórico-práticas
- Nota T1+T2 >= 6
- Nota final >= 10

Ou
Admitido a exame, se:
- Frequência de 60%* das aulas teórico-práticas;
- Nota final de período letivo igual ou superior a 6 valores.

Exame (60%) + 40%(relativo às avaliações práticas e desafios já realizadas)
Aprovado a exame se: Nota de exame >= 6
Bibliografia principal:
1.Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015.
2.Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010.
3.Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006.
4.An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N.C, Jones & P. Pevzner, MIT Press, 2004
5.Introduction to Bioinformatics, 4th Edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2014.
6. Artigos e material disponibilizado pelo docente.
Língua:
Português