Informática Aplicada às Ciências Biológicas

Não tem Fotografia:
Virginie dos Santos Felizardo
Código:
17252
Ano:
1
Semestre:
S1
Créditos ECTS:
6
Carga Horária:
PL(30H)/T(30H)
Área Científica:
Informática
Objectivos de Aprendizagem:
1. Identificar e descrever algoritmos e técnicas utilizadas em Bioinformática.

2. Explorar bases de dados de interesse biológico e extrair delas informação relevante.

3. Explorar ferramentas de interesse para resolução de problemas em biologia molecular e biomedicina.

4. Explorar implementações existentes dos algoritmos mais comuns para os diversos problemas computacionais e implementar as parametrizações os mesmos de forma adequada.

5. Identificar direções atuais em termos de investigação.
Conteúdos programáticos:
1. Introdução à Informática aplicada às Ciências Biológicas
2. Ferramentas, algoritmos e bibliotecas de bioinformática
3. Bases de dados de interesse Biológico
4. Métodos de análise de sequências (alinhamentos em pares)
5. Métodos para obter alinhamentos de múltiplas sequências e construção de árvores filogenéticas
6. Métodos de análise de expressão génica (clustering e biclustering)
7. Redes biológicas e métodos de análise de interação de proteínas
8. AlphaFold e previsão da estrutura de proteínas.
9. Tratamento e análise de dados biológicos.
Bibliografia principal:
1.Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015.
2.Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010.
3.Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006.
4.An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N.C, Jones & P. Pevzner, MIT Press, 2004
5.Introduction to Bioinformatics, 4th Edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2014.
6. Artigos e material disponibilizado pelo docente.
Língua:
Português