Bioquímica Estrutural

Código:
17256
Ano:
1
Semestre:
S2
Créditos ECTS:
6
Carga Horária:
TP(60H)
Área Científica:
Bioquímica
Objectivos de Aprendizagem:
Os objetivos desta UC são o de transmitir princípios que determinam estrutura de macromoléculas e relações estrutura-função, bem como técnicas usadas para a determinação de estruturas 3D de macromoléculas biológicas (Raios-X; RMN, CrioEM, técnicas biofísicas de caracterização estrutural). Com esta UC o estudante deverá possuir os conhecimentos em: 1) princípios que determinam a estrutura de macromoléculas (proteínas e ácidos nucleicos), 2) principais classes estruturais de macromoléculas e implicações biológicas, 3) implicações biológicas da estrutura. 4) adquirir conhecimentos das principais técnicas de determinação da estrutura 3D de macromoléculas biológicas (Cristalografia de Raios-X, RMN, CrioEM, técnicas biofísicas de caracterização estrutural). 5) interpretar corretamente os resultados estruturais e conhecer critérios de validação de estruturas. 6) Deverão dominar várias ferramentas computacionais on-line bem como diversos programas de visualização e representação molecular.
Conteúdos programáticos:
Introdução à Bioquímica Estrutural: organização molecular e hierarquia estrutural.
•Ligações químicas e forças intermoleculares em sistemas biológicos.
•Estrutura das proteínas: níveis estruturais, dobramento e estabilidade.
•Enzimas: estrutura, mecanismos catalíticos e regulação.
•Estrutura dos ácidos nucleicos e complexos proteína-DNA/RNA.
•Métodos de determinação estrutural: cristalografia de raios-X, RMN e cryo-EM, técnicas biofísicas de caracterização estrutural
•Dinâmica molecular e modelação computacional.
•Alterações estruturais associadas a doença.
Bibliografia principal:
- “Introduction to Protein Structure” Branden, C.-I. & Tooze, J. Garland Pub. (1999)
- “Crystallography made Crystal Clear- A Guide for users of Macromolecular Models” G. Rhodes, 2nd Ed., Academic Press: San Diego, London (2000)
- “Biomolecular NMR Spectroscopy”, Evans, J.N.S., Oxford University Press (1995)
- Teng, Q. “Structural Biology: Practical NMR applications” Springer Science, USA (2005)
- Wüthrich, K. “NMR of Protein and Nucleic Acids”, Wiley-Interscience Pub., (1986)
- Friebolin, H. “Basic One- and Two-Dimensional NMR Spectroscopy”, VCH publishers, New York-Germany, 2ª ed. (1993)
- Determinação de estruturas tridimensionais de proteinas, Anjos L. Macedo & Brian J. Goodfellow, Quimica, 63, 1996
-Artigos científicos selecionados (PubMed: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)
Língua:
Português