Informática Aplicada às Ciências Biológicas

Não tem Fotografia:
Virginie dos Santos Felizardo
Código:
18377
Ano:
1
Semestre:
S1
Créditos ECTS:
6
Carga Horária:
PL(30H)/T(30H)
Área Científica:
Informática
Objectivos de Aprendizagem:
1. Identificar e descrever algoritmos e técnicas utilizadas em Bioinformática.
2. Explorar bases de dados de interesse biológico e extrair delas informação relevante.
3. Explorar ferramentas de interesse para resolução de problemas em biologia molecular e biomedicina.
4. Explorar implementações existentes dos algoritmos mais comuns para os diversos problemas computacionais e implementar as parametrizações dos mesmos de forma adequada.
5. Identificar direções atuais em termos de investigação.
Conteúdos programáticos:
1.Introdução à programação em Python para as Ciências Biológicas
2.Repositórios e recursos públicos de informação biológica e biomédica
3.Bibliotecas Python para as Biociências
4.Aprendizagem Automática para as Ciências Biológicas
5.Inteligência Artificial Generativa nas Ciências Biológicas
Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação:
A avaliação do período de ensino-aprendizagem consiste na realização de 8 fichas práticas (FP, resolvidas em grupos), Discussão das fichas de práticas (D, individual), preenchimento de um portefólio de recursos e ferramentas de bioinformática (Prf, individual), e realização de um projeto de tratamento e análise de dados biológicos (P, em grupo).
Ponderações:
- 8 FP - 8x1 valor=8 valores
- Discussão (D) - 8x0.75=6 valores
- 1 Portefólio - 2 valores
- 1 Projeto - 4 valores
Critérios de frequência:
- Assiduidade mínima de 80% nas atividades da UC.
- Nota mínima de 6 valores.
Critérios de aprovação:
- Cumprir os critérios de frequência.
- A nota de cada ficha prática e discussão ser igual ou superior a 50%
- Nota final igual ou superior a 50% (10 valores) - Nota final= FP1+FP2+FP3+FP4+FP5+FP6+FP7+FP8+ Prf+D+P
Exames
Mesmas ponderações da avaliação de ensino-aprendizagem, em que as fichas práticas e discussão serão substituídos por um exame.
Bibliografia principal:
1.Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015.
2.Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010.
3.Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006.
4.An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N.C, Jones & P. Pevzner, MIT Press, 2004
5.Introduction to Bioinformatics, 4th Edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2014.
6. Artigos e material disponibilizado pelo docente.
Língua:
Português
Esta informação promove os seguintes Objetivos de Desenvolvimento Sustentável da ONU:
Garantir o acesso à saúde de qualidade e promover o bem-estar para todos, em todas as idades Garantir o acesso à educação inclusiva, de qualidade e equitativa, e promover oportunidades de aprendizagem ao longo da vida para todos Construir infraestruturas resilientes, promover a industrialização inclusiva e sustentável e fomentar a inovação