Ao Setor de Vencimentos compete:
- Processar os vencimentos e outros abonos do pessoal;
- Elaborar guias e relações para entrega ao Estado e outras entidades das importâncias e descontos que lhes são devidos;
- Inserir nas plataformas das diversas entidades informação sobre pessoal docente e não docente;
- Colaborar na elaboração do projeto de orçamento, no balanço social e ainda na prestação de informação às várias unidades e subunidades orgânicas;
- Assegurar a prestação de informação através da declaração anual e da declaração de rendimentos.