Código |
13422
|
Ano |
3
|
Semestre |
S2
|
Créditos ECTS |
6
|
Carga Horária |
PL(30H)/T(30H)
|
Área Científica |
Ciências Biomédicas
|
Tipo de ensino |
Presencial
|
Objectivos de Aprendizagem |
A disciplina visa apresentar aos alunos diferentes algoritmos e técnicas computacionais utilizadas na Bioinformática com foco na sua aplicação prática.
Objetivos específicos: O1) Familiarização com algoritmos e técnicas computacionais utilizadas actualmente em Bioinformática e respectiva aplicação à resolução de problemas em biologia e medicina. O2) Exploração de ferramentas computacionais e bases de dados de interesse para a resolução de problemas em Bioinformática. O3) Identificação de direcções para investigação em Bioinformática. O4) Aquisição e/ou reforço de soft skills tais como trabalho em equipa, capacidade analítica e de argumentação, discussão de ideias inter-pares e com os docentes, …
|
Conteúdos programáticos |
1.Introdução à Bioinformática 2.Bases de dados de interesse biológico 3.Noções básicas de Biologia Molecular 4.Noções básicas de Algoritmos 5.Alinhamento de sequências simples 6.Alinhamento de sequências múltiplas 7.Clustering e Biclustering 8.Árvores filogenéticas
|
Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
Aulas teóricas com exposição da matéria pelo professor seguida de discussão dos algoritmos apresentados, complementada com pequenos exercícios teórico-práticos. Aulas práticas com utilização de computadores e realização de trabalhos de grupo. Os estudantes têm oportunidade de, com orientação do professor, utilizar essas ferramentas e testar diferentes parametrizações.
|
Bibliografia principal |
1.Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015. 2.Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010. 3.Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006. 4.An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N.C, Jones & P. Pevzner, MIT Press, 2004 5.Introduction to Bioinformatics, 4th Edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2014. 6. Artigos e material disponibilizado pelo docente.
|
Língua |
Português
|