Ana Paula Coelho Duarte é docente e investigadora da UBI desde 1987, tendo integrado os departamentos de Ciência e Tecnologia do Papel e, posteriormente, de Ciências Médicas, onde assumiu um papel de destaque pelo trabalho desenvolvido, nomeadamente, na área das Ciências Farmacêuticas.
Ao longo da carreira desempenhou funções como Vice-Reitora da Investigação e Inovação, entre 2009 e 2013, tendo criado o Instituto Coordenador da Investigação.
Fez parte de vários elencos do Conselho Geral da UBI, coordenou o Centro de Investigação em Ciências da Saúde (CICS-UBI) e foi vice-presidente da Faculdade de Ciências da Saúde.
É Professora Catedrática desde 2009.