Código |
17252
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Ano |
1
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Semestre |
S1
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Créditos ECTS |
6
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Carga Horária |
PL(30H)/T(30H)
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Área Científica |
Informática
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Objectivos de Aprendizagem |
1. Identificar e descrever algoritmos e técnicas utilizadas em Bioinformática.
2. Explorar bases de dados de interesse biológico e extrair delas informação relevante.
3. Explorar ferramentas de interesse para resolução de problemas em biologia molecular e biomedicina.
4. Explorar implementações existentes dos algoritmos mais comuns para os diversos problemas computacionais e implementar as parametrizações os mesmos de forma adequada.
5. Identificar direções atuais em termos de investigação.
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Conteúdos programáticos |
1. Introdução à Informática aplicada às Ciências Biológicas 2. Ferramentas, algoritmos e bibliotecas de bioinformática 3. Bases de dados de interesse Biológico 4. Métodos de análise de sequências (alinhamentos em pares) 5. Métodos para obter alinhamentos de múltiplas sequências e construção de árvores filogenéticas 6. Métodos de análise de expressão génica (clustering e biclustering) 7. Redes biológicas e métodos de análise de interação de proteínas 8. AlphaFold e previsão da estrutura de proteínas. 9. Tratamento e análise de dados biológicos.
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Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
A avaliação do período de ensino-aprendizagem consiste na realização de 5 fichas práticas (FP, resolvidas individualmente), preenchimento de um portefólio de recursos e ferramentas de bioinformática (Prf, individual), resolução e entrega de um desafio (D, individual) e realização de um projeto de tratamento e análise de dados biológicos (P, em grupo).
Ponderações: - 5 Fichas práticas (5x2 valores =10 valores) - 1 Portefólio de recursos e ferramentas (2 valores) - 1 Desafio (3 valores) - 1 Projeto (5 valores)
Critérios de frequência: - Assiduidade mínima de 70% nas atividades da UC. - Nota mínima de 6 valores.
Critérios de aprovação: - Cumprir os critérios de frequência. - A nota de cada ficha prática ser igual ou superior a 50% (1 valor cada). - Nota final igual ou superior a 50% (10 valores) - Nota final= FP1+FP2+FP3+FP4+FP5+ Prf+D+P
Exames Mesmas ponderações da avaliação de ensino-aprendizagem, em que as fichas práticas serão substituídos por um exame.
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Bibliografia principal |
1.Bioinformatics: An Introduction, Jeremy Ramsden, Third Edition, Springer-Verlag London 2015. 2.Algorithms in Bioinformatics: A Practical Introduction, Wing-Kin Sung, CRC Press 2010. 3.Essential Bioinformatics, Jin Xiong Cambridge, University Press, 2006. 4.An Introduction to Bioinformatics Algorithms, N.C, Jones & P. Pevzner, MIT Press, 2004 5.Introduction to Bioinformatics, 4th Edition, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, 2014. 6. Artigos e material disponibilizado pelo docente.
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Língua |
Português
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