| Código |
17256
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| Ano |
1
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| Semestre |
S2
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| Créditos ECTS |
6
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| Carga Horária |
TP(60H)
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| Área Científica |
Bioquímica
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Objectivos de Aprendizagem |
Os objetivos desta UC são o de transmitir princípios que determinam estrutura de macromoléculas e relações estrutura-função, bem como técnicas usadas para a determinação de estruturas 3D de macromoléculas biológicas (Raios-X; RMN, CrioEM, técnicas biofísicas de caracterização estrutural). Com esta UC o estudante deverá possuir os conhecimentos em: 1) princípios que determinam a estrutura de macromoléculas (proteínas e ácidos nucleicos), 2) principais classes estruturais de macromoléculas e implicações biológicas, 3) implicações biológicas da estrutura. 4) adquirir conhecimentos das principais técnicas de determinação da estrutura 3D de macromoléculas biológicas (Cristalografia de Raios-X, RMN, CrioEM, técnicas biofísicas de caracterização estrutural). 5) interpretar corretamente os resultados estruturais e conhecer critérios de validação de estruturas. 6) Deverão dominar várias ferramentas computacionais on-line bem como diversos programas de visualização e representação molecular.
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Conteúdos programáticos |
Introdução à Bioquímica Estrutural: organização molecular e hierarquia estrutural.
•Ligações químicas e forças intermoleculares em sistemas biológicos.
•Estrutura das proteínas: níveis estruturais, dobramento e estabilidade.
•Enzimas: estrutura, mecanismos catalíticos e regulação.
•Estrutura dos ácidos nucleicos e complexos proteína-DNA/RNA.
•Métodos de determinação estrutural: cristalografia de raios-X, RMN e cryo-EM, técnicas biofísicas de caracterização estrutural
•Dinâmica molecular e modelação computacional.
•Alterações estruturais associadas a doença.
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Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
2 Testes (a média dos testes deve ser superior ou igual a 9,5 valores) ou Exame final (60%)
• Parte prática (grupo de dois ou três estudantes) incluindo realização de um quizz e a assiduidade às práticas (registada no início da aula) e Questionários (10%).
• Seminário e apresentação oral (15%+15%) sobre um tema da matéria dada em que os estudantes examinem de uma forma crítica um modelo estrutural da ação biológica de uma dada macromolécula, baseando-se na discussão de um artigo científico fornecido pelos docentes.
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Bibliografia principal |
- “Introduction to Protein Structure” Branden, C.-I. & Tooze, J. Garland Pub. (1999)
- “Crystallography made Crystal Clear- A Guide for users of Macromolecular Models” G. Rhodes, 2nd Ed., Academic Press: San Diego, London (2000)
- “Biomolecular NMR Spectroscopy”, Evans, J.N.S., Oxford University Press (1995)
- Teng, Q. “Structural Biology: Practical NMR applications” Springer Science, USA (2005)
- Wüthrich, K. “NMR of Protein and Nucleic Acids”, Wiley-Interscience Pub., (1986)
- Friebolin, H. “Basic One- and Two-Dimensional NMR Spectroscopy”, VCH publishers, New York-Germany, 2ª ed. (1993)
- Determinação de estruturas tridimensionais de proteinas, Anjos L. Macedo & Brian J. Goodfellow, Quimica, 63, 1996
-Artigos científicos selecionados (PubMed: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)
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| Língua |
Português
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