| Código |
15044
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| Ano |
1
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| Semestre |
S2
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| Créditos ECTS |
5
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| Carga Horária |
TP(40H)
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| Área Científica |
Biomedicina/Medicina/Bioquímica
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Objectivos de Aprendizagem |
Após a conclusão do curso, o aluno deverá:
- Conhecer as várias técnicas básicas e avançadas de microscopia de fluorescência usadas na investigação biomédica.
- Ter adquirido as noções fundamentais sobre métodos de análise de imagens como digitalização, aperfeiçoamento de imagem, segmentação e classificação de características.
- Saber selecionar o modo de aquisição de imagem adequada ao objetivo pretendido.
- Realizar medições manuais e automáticas usando ferramentas de análise de imagem.
- Realizar rastreamento de objetos.
-Entender as aplicações e limitações de cada técnica.
- Conhecer e aplicar as noções fundamentais de ética na análise de Imagem.
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Conteúdos programáticos |
- conceitos básicos em microscopia de fluorescência: diferentes fluorocromos, métodos de excitação, características de emissão, finalidade e usos.
- conceitos básicos sobre imagens digitais.
- métodos básicos de análise de imagem computadorizada
- Dados multidimensionais (2D, 3D, time-lapse, posição)
- processamento de imagem em preparação para análise, aperfeiçoamento de imagem
- análise de objetos / partículas, medidas de intensidade e morfométricas
- rastreamento do movimento de células ou partículas
- extração de dados quantitativos
- análise automática de grandes conjuntos de dados
- No curso serão também abordadas questões éticas associadas à aquisição e análise adequada de imagens.
- O curso proporciona ainda a introdução a várias ferramentas de software disponíveis gratuitamente (ImageJ/Fiji) e a algum software comercial (Imaris).
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Metodologias de Ensino e Critérios de Avaliação |
O curso consiste em sessões teórico-práticas, sessões práticas Hands-On nos laboratórios de microscopia e sessões práticas de análise de imagem.
As sessões teórico-práticas permitem fornecer as bases teóricas sobre as técnicas de microscopia de fluorescência e os conceitos base sobre aquisição e análise de imagens em investigação biomédica. As sessões Hands On possibilitam a aplicação dos conceitos apresentados nas sessões teórico-práticas e o uso das ferramentas disponíveis para construir fluxos de trabalho adequado para um determinado objetivo de investigação. A avaliação envolve a aplicação individual dos conhecimentos em contextos que os alunos poderão transpor para os seus projetos de investigação.
Cada aluno irá desenvolver um pequeno projeto individual e a avaliação irá consistir na realização de um trabalho escrito sobre o projeto desenvolvido e na apresentação e discussão deste mesmo trabalho
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Bibliografia principal |
Fluorescence Microscopy: From Principles to Biological Applications, 2nd Edition
Ulrich Kubitscheck (Editor)
ISBN: 978-3-527-33837-5 June 2017 Wiley-Blackwell
Bioimage Data Analysis, Edited by Kota Miura, Wiley-VCH
ePDF ISBN: 978-3-527-80092-6
Quantitative Imaging in Cell Biology, Methods in Cell Biology, Volume 123 (2014)
Editors Jennifer C. Waters & Torsten Wittmann
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| Língua |
Português
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